前述，我们提起，王骁老铁开发了一个 TBtools-Rplugin。这个 Plugin 事实上是一个 R ShinyApp。使用这个插件，几乎所有人可以在自己的电脑上轻松完成...
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超高速 WGCNA-基因共表达网络分析 ~ -
WGCNA（3）：基因模块与性状关联识别重要基因前面的文章中完成了数据导入和网络构建，下面是将基因模块与性状进行关联，从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
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FEELnc: LncRNA注释工具简介 这是一款2017年发表在NAR上的注释LncRNA的工具，FEELnc: a tool for long non-coding RNA annotation and i...
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TidyTuesday 可视化学习之 网络图（ igraph 和 ggraph） 绘制首先我是这是我日常逛 twitter 看到的，然后我又是一个搬运工（ emmm，这个系列都没有询问作者意见，后面如果有意外就删了。 ） 书籍在线版：R for Data Sc...
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【R>>ggh4x】ggplot2分面hacksggh4x是ggplot2的扩展包，其火星文发音为G-G-hacks。主要功能包括调整分面大小(adjusting the sizes of facets)，mapping ...
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重演一篇傻瓜式GWAS分析|培养兴趣专用重演一篇傻瓜式GWAS分析|培养兴趣专用[https://zhuanlan.zhihu.com/p/139428767] 发布于 2020-05-10 18:58 全基因组关...
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哈喽，我想问一下，不同物种（远缘）的重测序数据为什么可以比对到不同物种上，并且还具备较高的覆盖深度。
测序数据的深度、覆盖度等计算
Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段（短读 short reads）“覆盖”的强度有多大？ 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
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R绘图|染色体SNP指数图绘制文末可下载示例数据和代码。 前几天，老师让我画一个这样的图。 粗略一看，似乎没有什么特别困难的地方，好像之前也看到过类似的图，但是看到老师发来的链接才发现这居然是Nature...
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【SubPhaser-多倍体亚基因组分型流程解读】写本篇文章，主要目的是从tmp文件和软件运行信息解读亚基因组分型分析。 进入tmp文件夹之后，其实就可以看到对应的文件： 如何查看什么步骤产生了怎么样的结果文件？ 上述在进行...
