加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出
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snakemake使用笔记
snakemake是一个用来编写任务流程的工具，用python编写的，因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂，易于理解。 一、从一个简单的例子开始 1、安装snakemake 安...
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【Bioconductor系列】如何用Bioconductor对基因组注释
这一次，我们来聊聊基因组注释。首先问自己一个问题，为什么要进行基因注释。就我目前而言，它用来解决如下问题： 在mapping-by-sequencing的时候，我找到了一些可...
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使用R语言进行卡方检验（chi-square test）文|程瑞林（山东大学第二医院足踝外科）来源|（微信公众号）云中瑞麟（ID：ruilinfly） 瑞麟导读：对于计量资料，临床医学研究中常用的统计分析方法是t检验；而对于计数资...
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绘制差异基因kegg注释图
“差异基因kegg注释图”是转录组分析结果的重要组成部分，能够帮助大家了解差异基因分属于哪些代谢通路，文章中如果能够插入下面这类图来说明样品间的差异，一定会为你的文章增色不少...
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GTF/GFF文件的差异及其相互转换我们在做生物分析的时候，经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字，甚至连内容都极为相似~那么，他们究竟差在哪里呢？ GFF全称为general ...
