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    癌症细胞状态的十年探索:单细胞RNA测序的启示

    引言 在过去的十年里,单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术彻底改变了我们对复杂生物系统的理解,尤其是在癌症研究领域。癌症作为一种由多种遗传...

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    肿瘤免疫新视野:揭秘CXCL13+ T细胞对免疫检查点阻断的响应

    肿瘤免疫新视野:揭秘CXCL13+ T细胞对免疫检查点阻断的响应 在免疫治疗领域,探索肿瘤反应性T细胞对免疫检查点阻断(ICB)的响应机制一直是...

  • 批次将文件夹中的内容读入

    使用for循环 使用for循环,依次读入文件夹“input”中的文件,将读入的数据放入一个list 使用lapply 函数

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    单细胞分析(四)——数据读入

    要做单细胞分析,尤其是从公司拿回数据,或者从公共数据库下载的数据,看起来眼花缭乱的分析结果,首先第一步就是要把数据先读入,才能有后续的结果和分析...

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    单细胞分析(三)——细胞分群单独展示

    使用降维分析图展示marker基因 大部分单细胞分析,以及seurat package这个包给出的示例,也都是某一marker基因在降维分析之后...

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    单细胞分析(二)——细胞注释(SingleR自动注释)

    单细胞分析数据后,得到族群后,如何将族群进行细胞名称注释是重要的步骤。这里使用SingleR 进行简单的自动注释。 安装需要的R包 需要两个包S...

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    单细胞分析(一)——seurat包单个样本处理

    10X genomics的基本原理 在这个教程中,主要将分析 10X Genomics 免费提供的外周血单核细胞 (PBMC) 数据集。在 Il...

  • 报错处理——object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found

    在使用Seurat进行单细胞分析时,使用FindNeighbors函数功能时,出现下面的报错 这是Matrix这个包有问题,需要更新Rtools...

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    IMvigor210CoreBiologies的安装以及数据获取

    关于这个包的相关介绍,作者在这个网站进行了介绍http://research-pub.gene.com/IMvigor210CoreBiolog...