关键词:表观年龄, 表观时钟,甲基化时钟,甲基化年龄,epigenetic clocks, Horvath clock 该博文主要介绍我们开发的一个基于甲基化芯片数据预测各种...
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写在前面的话 你既然点进来了,说明你多半用过这个软件。但我猜,大多数人早期使用这个软件的时候,一定是赶鸭子上架:因为要画图,所以必须会。 但你真的懂了么? 太长不看系列 对于...
曼哈顿图的名字来源是因为其形如曼哈顿的天际线:高耸在较低高度的“建筑物”上方的摩天大楼的轮廓。主要用于GWAS结果的展示,今天让我们来看看如何绘制曼哈顿图。 什么是曼哈顿图 ...
引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段,彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析(Genome Wide Association ...
作者,Evil Genius 分享一个数据库,CROST, CROST应用标准化处理流程整合了182个高质量的空间转录组数据集,涵盖8个不同物种、35种组织类型和56种疾病的...
1 关键细胞类型或Marker缩写: 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...
背marker list 不要贪多哦,要慢慢地背,一个一个一个地背,然后背了再很快地忘记,如此反复。 外周血单个核细胞(Peripheral blood mononucle...
在单细胞数据分析中,在确定细胞类型后,除了可以进行差异表达基因分析外,还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析,这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...
AverageExpression gzh:BBio Seurat中用于计算cluster基因平均表达值的函数,为啥这个结果和FindMarkers中差异倍数avg_logF...