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    BWT比对算法

    简介 BWT算法在多款序列比对软件(BWA,bowtie)中都有涉及,那么对于RNA-seq的2代数据,一般建库长度是单端300bp,双端各150bp左右。 序列比对 对于两...

  • 三代ONT甲基化相关分析软件

    一、deepmod 1、三代测序得到的fast5文件是muti fast5,一个fast5文件里面有4000条fast5序列,deepmod不支持muti fast5,需要拆...

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    ChIP-seq基础入门

    理解ChIP-Seq 到了目前这个水平,我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 转录组主要研究的问题是基因在不...

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    cutadapt 使用详解

    Cutadapt安装 基本命令 例子: 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters:adapter...

  • array模块

    Python 本来没有数组这种数据类型,不过有内置模块array,和列表的很多方法非常类似。其中的array的数据类型和C一致,非常丰富,可以在较大的序列生成和计算中代替列表...

  • 逻辑运算符:not and or

    关于python的逻辑运算符,日常使用比较简单化,然而在面试中可能会有这样的问题: 这种问题如何解决? 优先级: () > not > and > or 使用规则: a an...

  • python3 re模块的使用

    正则表达式(regular expression)是一个特殊的字符序列,它能够帮助我们检查一个字符串是否与某种模式匹配。Python中的re模块为python提供了类似于Pe...

  • Python进制转化

    Python中的进制有二进制、八进制、十进制、十六进制,用python的内置函数可以方便的进行不同进制之间的转换,二、八、十六进制数字表示前面分别添加0b、0o、0x(前面为...

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    Mac 安装oh-my-zsh

    Zsh是苹果2019年公布的下一代shell,用来取代bash。相对于bash来说,zsh拥有更多更强大的功能:更智能的自动补全、命令选项提示、更丰富的主题。我的Mac最近总...

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    使用pheatmap包绘制热图

    加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出

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    VMware和centOS安装

    VMware安装 可用的破解秘钥 下载centOS 官网下载 安装centOS 选择下载好的镜像 设置配置 安装centOS,此处需要在隐私中勾选VMware,否则不能在虚拟...