这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读，对于有一定经验的老手来说，相信依然可以有...
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从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第4节 构建WGS主流程 -
为什么不能通过 GATK 的 PL 直接计算基因型剂量（Genotype dosage）
GATK 的 PL 比较特殊，它是不能直接用于基因型剂量（Genotype dosage）的计算的。这次我们就来谈一谈这个问题。 有时候我们需要在项目中用基因型剂量来代替基因...
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基因型填充(Genotype-Imputation)：从原理到操作移步 github 实现目录跳转，获得更好的阅读体验 目录 基因型填充1.1. 问题描述1.2. 技术来源的基因型缺失1.3. 缺失的判断：缺失率1.4. 基因型缺失的影响1...
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Illumina Hiseq/Miseq测序原理简介一、Solexa测序技术前世今生（——Illumina平台） Solexa高通量测序技术是由英国剑桥大学派生的Solexa公司建立起来的。该方法以单分子阵列技术为基础，是对合...
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GWAS基本分析内容之前给大家大致介绍了GWAS在临床生信分析中的概况，包括一些基本概念，原理和注意事项（出门左手边—>临床生物信息学中的GWAS分析），这次具体讲讲GWAS基本分析内容及结果解...
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HLA--polysolver文章来自：Comprehensive analysis of cancer-associated somatic mutations in class I HLA genes...
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Fisher's exact test( 费希尔精确检验) 以及R中的计算
Fisher's exact test( 费希尔精确检验) 是用于分析列联表（contingency tables）统计显著性检验方法，它用于检验两个分类的关联（associ...
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1000G | 数据下载-待补充1000G简单介绍 千人基因组也许是被研究得和使用得最多的数据库了。其包含的个体是来自不同人群（如欧美、亚洲等）的健康对照样本，可以很方便的下载到原始数据，在缺乏对照研究时可...
