ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...
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前言 我的认知里,fasta格式中“>”只会位于行首。但是我写脚本用的示例数据里出两行特殊id。这两个id中除了行首的“>”,中间还有“>”,造成原脚本不能适用。所以在脚本里...
01 基因富集分析基本概念 今天我们来讲一讲什么是基因富集分析 首先我们要抓住一个核心,那就是: “将我们挑出来的基因归归类,聚类分析,看看这些基因的功能和我们的研究是否具有...
笔记内容:由二代测序产生的序列数据(.fastq)到OTU table, 距离矩阵,物种多样性指数,序列的进化树及物种注释信息的可分析数据,为常规分析流程。可以使用usear...
ComplexHeatmap学习笔记①Introduction to ComplexHeatmap package ComplexHeatmap学习笔记②Making A S...
LPSN全称List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature。源自1997,近期更新发表文章于2020。该数据库...
由于论文问题,这里重做了mantel test,所以记录一下完整的重做过程。首先是运行语言,这路选择R语言作为计算语言。 1 package ggcor作者删除了账号,不知...
主成分分析(PCA)是一种无监督降维方法,能够有效对高维数据进行处理。但PCA对相关性较小的变量不敏感,而PLS-DA(偏最小二乘判别分析)能够有效解决这个问题。而OPLS-...
简介例1. 不同品种代谢产物OPLS-DA loading plot1 安装2 内置数据介绍 代谢物对个体性别的定性响应 - PLS执行PLS-DA结果参数解释模型评估常用可...