转自：https://www.jianshu.com/p/9d28de3d18e6[https://www.jianshu.com/p/9d28de3d18e6] 一、4Dt...
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全基因组复制 WGD |（二）Ka/Ks及4Dtv值计算 -
如何快速将参考基因组拆分为各条染色体序列？
需求 客户反映，完整的基因组太大打不开，要我将之按各条染色体和scaffold拆分。如何快速实现？ 方法一 借助工具： 方法二 自己写脚本：split.pl 运行：perl ...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析谈论到直系同源基因分析的时候，大部分教程都是介绍OrthoMCL，这是2003年发表的一个工具，目前的引用次数已经达到了3000多，但这个软件似乎在2013年之后就不在更新，...
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基因组重复序列检测：RepeatMasker的安装及使用RepeatMasker是重复序列检测的常用工具，通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列，属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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conda安装软件与环境管理利用bioconda 安装生物信息软件 通过conda安装软件，首先从官网[https://github.com/bioconda/bioconda.github.io/tr...
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基因家族分析（1）数据准备及软件安装基因组数据的准备 进行全基因水平的基因家族鉴定之前，需要准备好一套基因组数据，基因组数据可以从公共数据库下载，也可以根据基因组文献提供的地址到指定网站进行下载。一套完整的数据...
