import pandas as pdimport numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom mpl_toolkits.m...
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安装命令,可随意起一个主机名 然后VScode的terminal 或 win +R ,cmd:输入 wsl,及进入linux命令界面 若不想进入linux cmd界面,只...
输入文件1:nwk文件;输入文件2:两列的分组文件
交叉原理与基因重组距离计算 我们讨论了交叉的原理。这节课上,我们将利用该原理来计算基因间的重组距离。随后,你会看到我们如何利用该原理组建出基因组图谱或是多个基因MAP。 基因...
在上一节中我们讲到了基本的演化原理,以及为什么自然选择推动物种演化是数学性的必然。我们也提到了尽管人们对于生物演化有着不同的理解,演化学课程也被允许在各种学校里教授。这一讲里...
讲者Mohamed Noor, 是杜克大学的一名教授 我很高兴在此与你们谈谈遗传与进化 这第一条视频我们来看看什么是进化 ,我们会看到进化的证据 ,以及对批判进化论的回应 现...
应用程序 本课程有一个免费的应用程序,可用于 iPhone 和安卓手机。您可以在这里找到更多相关信息[http://people.duke.edu/~noor/genevol...
@朝赤 Porechop:
Porechop是专门为纳米孔测序数据设计的工具,用于切除接头和其他低质量区域。它可以自动检测并切除接头序列。
GitHub链接: https://github.com/rrwick/Porechop
NanoFilt:
NanoFilt是一个轻量级的工具,主要用于过滤和修剪纳米孔测序的FastQ文件。虽然它主要用于过滤,但也可以用于简单的接头修剪。
GitHub链接: https://github.com/wdecoster/nanofilt
Nanopore测序及数据处理一、工作原理 新型纳米孔测序法(nanopore sequencing);采用电泳技术。 Nanopore测序当中的核心部件是这个由蛋白质构成的纳米级的小孔,我...
高通量模板制备是高通量测序中的关键步骤,旨在为测序平台(如Illumina、Ion Torrent、PacBio和Oxford Nanopore等)提供适合的核酸模板。以下是...
高通量文库构建是现代基因组学研究中不可或缺的一部分,特别是在下一代测序(NGS)技术中。文库构建的质量直接影响到后续测序的准确性和数据分析的可靠性。以下是高通量文库构建的一般...
核酸提取是从生物样品中分离和纯化DNA或RNA的过程。这一过程对于分子生物学研究、基因诊断、基因工程等领域至关重要。核酸提取的方法多种多样,但其基本原理相似,主要步骤包括细胞...
以下是完全来自AI的脚本,给到的指令是: python 脚本,柱状图,我有一个多年份的统计表,输入文件第一列为横坐标“药物”,输入文件第二列及之后的列为每一年的数据,每一行的...
以下是完全来自AI的脚本,给到的指令是:python 脚本,柱状图,我有一个多年份的统计表,输入文件第一列为横坐标“药物”,输入文件第二列及之后的列为每一年的数据,每一行的数...
使用python的模块edlib,可实现要比较的两种变异的全局比对(mode=“HW”),通过输入要比较的两种标记的ref,alt;分别获得对应的全局比对后的格式,然后再做比...
pandas进行表格的合并
输入文件: 如下脚本想实现质量值的频次分布,同时每种质量值的reads对应的长度,来判断质量值和长度的关系。如下图展示了质量值为38的序列长度偏短。