0.背景知识 TCGA或TCGA+GTEx的表达矩阵,行名都是ensamble id,因为TCGA数据的参考基因组版本是genecode V22,xena重新分析的TCGA+...
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0.背景知识 TCGA或TCGA+GTEx的表达矩阵,行名都是ensamble id,因为TCGA数据的参考基因组版本是genecode V22,xena重新分析的TCGA+...
和多个临床特征相关联的作图,以均值作为比较项 library(limma)library(ggpubr) expFile="TCGA_rpkm.txt" #表...
曼哈顿图的名字来源是因为其形如曼哈顿的天际线:高耸在较低高度的“建筑物”上方的摩天大楼的轮廓。主要用于GWAS结果的展示,今天让我们来看看如何绘制曼哈顿图。 什么是曼哈顿图 ...
通过前面的数据下载,我们一般都可以得到如下矩阵,为了后续分析及文章需要,我们则需要吧探针名转化为gene_symbol ID转化主要分为二步 Ⅰ、得到探针一一对应的基因名Ⅱ、...