系统:linux/ubuntu 权限:root权限执行 参考网址:Ubuntu Packages For R - Full Instructions (r-project.o...
随着转录组技术的发展,空间转录组已经正式走向商业化时代,作为单细胞数据分析的工具箱的Seurat与时俱进,也相应地开发了空间转录组分析的一套函数,让我们跟随卑微小王看看Seu...
一、什么是批次效应 批次效应(batch effect),表示样品在不同批次中处理和测量产生的与试验期间记录的任何生物变异无关的技术差异。批次效应是高通量试验中常见的变异来源...
linux 系统报错: cannot create temp file for here-document: No space left on device,显然是磁盘完全占...
火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多,Excel和第三方软件等,本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
系统安装体验建议: 1. ubuntu server 18.04 版本安装时候,选择安装软件步骤: 安装ssh-server,便于远程登录操作,方便进一步配置; 2. 个人...
8种特殊建库测序 8种特殊建库测序 1. RNA-seq 2. 外显子测序 3. small RNA-seq 4. 单细胞DNA测序 5. 单细胞mRNA测序 6. 甲基化测...
该文章是对 https://www.youtube.com/watch?v=VvS8NEJGxnM 这个视频进行的总结梳理。 特此感谢陈巍老师,更多关于基因的内容请关注微信公...
刘小泽写于18.11.25每学习一遍之前的知识,总能从不同角度获取一些观点,然后扩增自己的知识库,这就是“知识迭代”这次我也就是想到哪写到哪,把自己认为重要的内容梳理下,用Q...
一般同一批样本送去测序,测序使用的DNA材料和测序深度基本比较接近(PCR系统偏差稳定),这样的前提下,我认为RPKM和FPKM还是还是具有可比较性的。
为什么说FPKM和RPKM都错了?这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文,一些偶然的机会,发现不少朋友也在讨论这个问题,因此我重新做了梳理并发出来。这样的讨论是有益的,放在今天也不过时,我也愿意和更多的朋友...