有时候,我们从GEO数据库挖掘了好几组数据集的差异表达基因,我们需要统计这些基因列表的交集,一般可以用韦恩图和Upset图。而韦恩图一般适合小样本的交集,而多个样本的话可以用...
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下载数据 TCGA官网下载TCGA-COAD projiect的HTSeq-counts 和clinical的manifest文件。然后在电脑终端用gdc-client下载数...
听了颉伟老师8.26晚上的一个关于近期工作的汇报,整理如下: minor ZGA & major ZGA minor ZGA的特点:虽然只是少量Gene开启转录,但转录量可以...
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本想注销账号,后来随便翻了翻,还是没舍得。简书曾让我投入了很多感情,码文章也占用了我很多时间,就像自己养大的花一样,不是随便就能掐死的。停更大概一年了,主要原因是认识到自己有...
简介 R bookdown 可以看作使用 Markdown 进行排版的 Latex 软件。你用 Markdown 来写文章或书籍,它用 Latex 渲染出来,输出排版优美的 ...
TCGA学习01:数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02:差异分析 - 简书 TCGA学习03:生存分析 - 简书 TCGA学习04:建模预测-cox回归 - 简书...
我在简书和公众号上已经分享了很多之前学习的数据分析笔记和文章,覆盖了各方面的内容,数据分析方面以后不会再个人分享特别基础的东西了。接下来我会让师弟师妹们定期分享自己的学习过程...