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    cj的院服务器数据下载及平台搭建

    激活环境 conda activate cj 如何看有啥软件已经安装 conda list aspera下载数据 记得联网(悄悄地) 查找asc...

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    R获取KEGG/GO中某一通路所有基因

    1、通过KEGGREST包来探索KEGG数据库的12大代谢通路 通过观察KEGG官网 :https://www.genome.jp/kegg/p...

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    根据转录组和KEGG代谢基因计算通路活性

    !!!计算方法是以前初师兄根本文献扒的,后续把文章doi附上!!!KEGG基因list,利用R可以很快扒下来,我后面再更新,百度一下你就知道 准...

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    count转fpkm和tpm

    以下列数据为例子,需要count矩阵并包含基因长度、(没有的话从gtf提取,前面我写过教程) count矩阵读入 count to TPM co...

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    转录组服务器配置

    以大设施anlei01环境为例 1、配置miniconda软件 2、设置环境 建立一个RNA-seq分析环境,这样是为了和其他环境区分开,以免本...

  • 越哥服务器上分析流程留存

    把sortbam文件全部上传到越哥服务器上给服务器上安装了bedgraphtobw,直接用就行了传文件使用的命令是 1、合并bam 2、bam转...

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    conda装好软件后库文件缺失问题

    在学校服务器上conda安装软件后 提示安装成功但是bowtie2报错缺失库文件 由于我是非root用户,权限受限在两位老师@exps和@wan...

  • 越哥cuttag分析代码留存

    1、trim_galore去接头及低质量reads 使用nohup挂后台后可以用jobs -l查看 跑完以后在clean文件夹下,会有val_1...

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    【傻瓜美图】cellphonedb气泡图

    从cellphonedb得到以下四个文件,用中间两个画图 画图

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小王小王,垃圾大王