什么是组间差异检验？就是组间的差异分析以及显著性检验，应用统计学上的假设检验方法，检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲，所有的差异检验都基于一个假设：组间没有差异，变量之...
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组间差异检验，终于有人讲清楚了! -
Ubuntu运行salmon时报错liblzma.so.0
然后我就尝试运行以下代码，发现没用 sudo apt-get update -ysudo apt-get install -y liblzma-dev 系统更新，还有一个报错...
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微生物组学差异性检验
1. Adonis vegan包置换多因素方差分析（非参数多因素方差分析），可对OTU矩阵及所有环境因子矩阵进行差异性检验。 otu_env.adonis = adonis(...
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统计学之三大相关性系数（pearson、spearman、kendall）关注公众号：“程序员成长软技能” ，日拱一卒，功不唐捐！（转自 微信公众号克里克学苑）三个相关性系数（pearson, spearman, kendall）反应的都是两个变...
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群落多样性之Beta多样性（一）0 导语 再过不到一个月，就要高考了。考试固然重要，它检验的是努力，决定了起点的高度；报考更重要，它是方向，让考生从无限可能步入可能中的一种，决定了考生的未来。是啊，任你分数...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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SRA Toolkit下载SRA数据
1.下载 https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software 或者 wget "ftp://ftp...
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受用
linux mac添加环境变量
一般情况下，需要添加可执行权限 chmod +x software_name 然后写进环境变量中，加到环境变量的路径必须是全路径，全路径指以/开头或已 ~开头的路径 (~开头...
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答生信从业人员的N个问题（更新非常慢）问题链接：http://www.jianshu.com/p/88611ef94bd7 Ubuntu 相关 chmod的用途，场景 chmod即change mode, 是用于...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从fastq测序数据到OTU table笔记内容：由二代测序产生的序列数据（fastq格式）到物种丰度的OTU table， 样本群落距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的分析结果，为常规分析流程。...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从OTU table到marker物种笔记内容：由二代测序产生的序列数据（.fastq）到OTU table， 距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的可分析数据，为常规分析流程。可以使用usear...
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鉴别确定性和随机过程微生物群落构建过程中的相对重要性
科学问题：弄清生物群落的构建(community assembly)机制（如生物多样性是如何形成、维持、演替的？）一直是生态学研究所关心的热点问题 自然界中为什么会有如此多的...
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测序数据基本信息统计 | reads,coverage,depth
00 写在前面 测序后公司交付数据时，一般会提供质控后的clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理，记得一定要拿回raw data，同时弄清...
