曼哈顿图的名字来源是因为其形如曼哈顿的天际线:高耸在较低高度的“建筑物”上方的摩天大楼的轮廓。主要用于GWAS结果的展示,今天让我们来看看如何绘制曼哈顿图。 什么是曼哈顿图 ...
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曼哈顿图的名字来源是因为其形如曼哈顿的天际线:高耸在较低高度的“建筑物”上方的摩天大楼的轮廓。主要用于GWAS结果的展示,今天让我们来看看如何绘制曼哈顿图。 什么是曼哈顿图 ...
安装并加载所需R包 基本用法 常用参数 加载并查看示例数据 基本数据格式: 前三列分别为SNP的名称,所在染色体,SNP的位置,后面每列为不同性状的P值,每个性状单独一列 默...
参考学习资料: https://mp.weixin.qq.com/s/ou9MfogMJJV00S6lZpNGqQ 多基因风险评分PRS分析 目前的主流的 GWAS 分析使用...
自己找了一些文章和视频,先总结了一部分,后面再做补充和实操 一. 相关概念理解 (1)GWAS: 全称“全基因组关联分析”,使用统计模型找到与性状关联的位点,用于分子标记选择...
来源网站:http://dbtemp.blogspot.com/2011/08/sem-approach-to-twin-data.html 这个简单模型中最重要的假设是:双...
前言 关于全基因组关联分析(GWAS)原理的资料,网上有很多。 这也是我写了这么多GWAS的软件教程,却从来没有写过GWAS计算原理的原因。 恰巧之前微博上某位小可爱提问能否...
转自:http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因组重测序是通过对已有参考序列(...
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的学习 1.什么是vcf?VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文本文件。在GATK软件中得到最好...