前言 使用 pheatmap 已经能够绘制满足大多数要求的聚类热图了。 受 pheatmap 包的启发,ComplexHeatmap 提供了对热图更多更灵活的控制,如多数据热...
Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutoria...
前言 MEGENA是一种基于图嵌入的方式构建基因共表达网络的工具,相比较于WGCNA的权重分析,MEGENA直接用图对嵌入来完成,因此更加接近于真实情况 MEGENA理论 O...
差异表达分析内容:• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts,RPKM,FPKM,TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ limma-voom,edge...
欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Ontology是研究基因功能的重要数据库之一,在进行GO的富集分析时,需要提供所有基因对应的GO注释信息,本文介绍几种获取该信息的方式...