小洁老师 病理方面的生信你们有做过吗？或者有看到相关文献吗
一篇数据挖掘文章的图表复现-10.文章 文章标题：Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related signature to eval...
IP属地：广西壮族自治区
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教你画双分类变量的箱线图背景基础 箱线图的解释： 添加p值的需求 这样的箱线图，添加p值的需求是很多见的，核心就是stat_compare_means函数，可以很轻易搜到代码： 加难度 如题，有的箱...
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快捷查找KEGG里的通路和基因
需求 1.快捷查找ID对应的description，知道通路对应的编号是多少。2.找出某一个/几个通路里的全部基因，用来做单独的下游分析。 如果是要做KEGG的富集分析，cl...
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@晚安喵0629 那at那个可以做gsea分析吗
KEGG、GO富集分析与GSEA并不是二选一
最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因做得不到结果，那是因为确实富集不到任何通路，是正常的。不妨试...
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@小洁忘了怎么分身 对对😂这样子，谢谢小洁老师
KEGG、GO富集分析与GSEA并不是二选一
最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因做得不到结果，那是因为确实富集不到任何通路，是正常的。不妨试...
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GSEA 从数据到美图0.输入文件和R包 文件有两个，一个是差异分析结果；一个是msigdb数据库下载的gmt文件。 gsea要求的输入数据格式是排序后的logFC值，数据类型为向量，向量名字是e...
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小洁老师，这个deg里面的probid怎么跟我们平时的不一样呢，为什么不是……st之类的，那这个实际上怎么获得呢😂😂😂
KEGG、GO富集分析与GSEA并不是二选一
最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因做得不到结果，那是因为确实富集不到任何通路，是正常的。不妨试...
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想问一下那个红蓝色过渡带怎么画出来呀，我画的跟您文章末尾那个一样，这样子的话我怎么知道哪里是哪个组别呀
基因表达分析（中）- 富集分析
回顾 首先对基因表达分析（上）做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具：RNA-Seq，microarray， qRT-PCR等（欢迎补充） RNA-Seq，microar...
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复现：纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程，但是发现了几个不一样的地方，所以重新整理流程，代码主要来自原作者Juan_NF。 文...
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GEO数据挖掘之使用clusterProfiler进行GO/KEGG富集分析clusterProfiler是一个功能强大的R包，同时支持GO和KEGG的富集分析,是生信技能树[生信爆款入门课程]GEO数据挖掘的重点。为拓展课堂所学知识，现在找一个数据...
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KEGG、GO富集分析与GSEA并不是二选一最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因做得不到结果，那是因为确实富集不到任何通路，是正常的。不妨试...