冗余分析(redundancy analysis,RDA)是一种回归分析结合主成分分析的排序方法,也是多响应变量(multiresponse)回归分析的拓展。从概念上讲,RD...
冗余分析(redundancy analysis,RDA)是一种回归分析结合主成分分析的排序方法,也是多响应变量(multiresponse)回归分析的拓展。从概念上讲,RD...
上一节数量生态学笔记||冗余分析(RDA)概述中,我们回顾了RDA的计算过程,不管这个过程我们有没有理解透彻,我希望你能知道的是:RDA是响应变量矩阵与解释变量之间多元多重线...
起了个大早做这张导图,不知道会不会吓到大家。有一周没有更新我们的《数量生态学笔记》了,因为这一章还是蛮有难度的,书中就是说这一章我们来讲典范排序,然后就直接讲RDA了。看RD...
笔记内容:用ggplot2绘制scatterplot with confidence ellipsesenvfit的R实现及释意用ggpubr绘制scatterplot wi...
非度量多维尺度分析(Non-metric multidimensional scaling,NMDS)是间接梯度分析方法,其基于距离或不相似矩阵产生排序。与尝试最大化排序中的...
什么是组间差异检验?就是组间的差异分析以及显著性检验,应用统计学上的假设检验方法,检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲,所有的差异检验都基于一个假设:组间没有差异,变量之...
笔记内容:由二代测序产生的序列数据(.fastq)到OTU table, 距离矩阵,物种多样性指数,序列的进化树及物种注释信息的可分析数据,为常规分析流程。可以使用usear...
Visualizing and Annotating Phylogenetic Trees with R+ggtreefacet_plot: a general soluti...
又要开始新的旅程了。 这一次是大名鼎鼎的《机器学习实战》。在2018年10月20日着手写《环境与生态统计:R语言应用》的时候,就想过这本书了,那个时候真的不敢写,觉得时间还没...