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snakemake--我最喜欢的流程管理工具使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者对已有的工具进行很好的分...
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Markdown的常用语法(个人总结)
简介 Markdown 是一种轻量级标记语言，它用简洁的语法代替排版，使我们专心于码字。它的目标是实现易读易写，成为一种适用于网络的书写语言。同时，Markdown支持嵌入h...
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生信码农：流程脚本编写规范
流程是介于脚本与软件的一组代码文件，所以在写流程的时候要知道脚本的基本结构以及软件开发的基本常识。前者要掌握，后者要了解。 出于掌握的需要，重温一下： Name:脚本名字 D...
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ggplot2：方差分析多重比较标注显著字母赖江山老师在科学网分享了Francois Gillet编写的两个方差分析多重比较的函数 boxplert()和boxplerk()【来源Numerical Ecology w...
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基因组重测序数据分析脚本
生成的文件说明： 1.~/Process/fastqc_result 用于存放质量评估的结果2.~/Process/trim_out 用于存放过滤的结果3.~/Process...
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测序的PCR duplicates - I（转载）在做NGS data处理的时候，常常会遇到需要使用picard和samtools 进行remove PCR duplicates的步骤。在网上查了一下 PCR duplica...
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2018-07-19记录
mentohust连接校园网linux版的锐捷不稳定，有时候即使认证成功也上不了网。找了半天没发现问题在哪里，遂放弃。下了个mentohust。要在google code上下...
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