3010份亚洲稻群体重测序项目是由中国农业科学院作物科学研究所牵头，联合国际水稻研究所、华大基因等16家单位共同完成。该研究对来自89个国家的3,010份水稻品种进行了重测序...
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3K水稻SNP数据集的简单利用 -
Dsuite: 从VCF文件中快速计算D-统计量和亲缘相关性的工具
工具背景介绍 D统计量（也称为ABBA-BABA统计量）和相关统计量通常用于评估种群或紧密相关物种之间的是否存在基因流。当前计算D统计量的工具大多数都需要该工具自定义特定的文...
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Tajima's D 中性检测的指标
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究员田田文...
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「博客翻译」SNP过滤教程（一）原文地址: SNP Filtering Tutorial 感觉文章写的真棒，于是就翻译了一遍 目标 学习如何使用VCFtools根据缺失信息，基因型深度(genotype d...
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群体遗传笔记（一）：群体间选择信号的检测及GO注释从获取下机数据做质控、比对，到calling snp获得vcf文件这一步，网上已经有非常详细的教程，有GATK4.0和全基因组数据分析实践（上），还有Samtools+bcf...
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群体遗传学习笔记-基因型缺失数据的填充
Genotype Imputation是在高通量测序中常出现的定义，按照义译就是基因型填充。要真正理解imputation这个概念，我们就需要先理解基因型缺失（genotyp...
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全基因组重测序基础及高级分析知识汇总
转自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因组重测序是通过对已有参考序列（...
