写在前面 性别被称为“进化生物学问题的皇后”，一直是生命科学领域中最具吸引力和最热门研究方向之一。而有性生物其性染色体的解析是性别研究的基础，这篇文章主要介绍一套鉴定性染色体...
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性染色体的鉴定（GATK4） -
计算分子进化-搞懂PAML的正选择分析许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析。无论是文章，还是教程，大多只...
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预测氨基酸替换有害性摘要 在单核苷酸多态性(SNP)数据和大规模随机突变项目中发现了许多错义替换。每一种氨基酸的替换都可能影响蛋白质的功能。我们已经构建了一个工具，利用序列同源性来预测替换是否影...
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基因组文章 | 南美白对虾《Nature communications》2019
南美白对虾，不仅做为一种重要的水产经济动物被广泛养殖，因其生态学意义及对环境的适应性也受到广泛研究。今天跟大家分享一下最近刊登在Nature Communications的南...
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【基因组——天麻】天麻基因组揭露植物适应异养
Mycoheterotrophs（真菌异养型植物）：植物和真菌的共生大概开始于450百万年前。真菌异养是一种特殊的植物-真菌共生类型，植物从共生真菌获得固定碳和其他营养物质，...
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烟草转录因子WRKY70的启动子分析这是我替同事做的一个启动子顺式元件预测，简单介绍下流程。 目的：从同事的描述中，我大概确定客户想研究WRKY70转录因子对烟草抗逆性的调控，并且想对自己的启动子做一个顺式元件...
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生物基础知识-CDS、ORF、启动子、终止子、转录因子、UTR刘小泽写于2020.2.8大概回顾一下基础知识 一：ORF与CDS ORF：open reading frame（开放阅读框） 它是理论上的蛋白编码区，一般是先在DNA序列中...
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2020年转录组文章到底有多难发？一文说明白！转录组是一类让人既爱又恨的项目，实验门槛低，却是文章泛滥的重灾区，总有人问小编，现在转录组还能发文章吗？下面小编就借一篇2020年5月4日发表在BMC Genomics上题为...
