1. 数据准备 2. 生成距离矩阵， 多个矩阵的列名及顺序必须一致 3. 定义简单函数 row()和col()函数用于取矩阵元素的行或列下标矩阵。row(as.factor ...
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R语言之将对称矩阵转为列表 -
基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（下）最近刚返校，事情比较多，每天也很忙，之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）》也一直没来得及更新，缺少cafe输出结果的解读及后面的可视化。最近在简书上也收到了...
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NGS产品经理篇：线上培训业务逻辑如今的培训已经是NGS业务的常态了，这种常态还会持续一段时间，不只是因为这是一个超指数发展的行业，更是因为人们日益增长的对生命科学的厚望与单个团体单薄的技术储备之间的矛盾。于...
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EffectiveT3 软件预测T3SS效应蛋白一、主页 官网：https://effectors.csb.univie.ac.at/method/effectivet3[https://effectors.csb.uni...
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HMMER3.1使用最近在探索全基因组基因家族的分析方法，而找到某一家族需要通过保守结构域来预测，从而找到物种的某一基因家族，从而进行之后的分析。这里就需要用到HMMER3.1软件，鉴定物种某一...
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我在简书的第4周年
今天登陆简书的时候看到了一个提示，提醒我已经加入简书4周年了。 不知不觉已经写了将近50多万的字（不计代码），也没有想到原来我加入简书正好是五四。 正如当我的粉丝数达到400...
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R 函数笔记 | grep()函数与R语言中的正则表达式
grep()能对向量中特定条件的元素进行查询，默认return为index。grep()语法与grep()大致相似，但默认return为logical。 grep() 代码如...
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R语言常用的数据处理的包(2)
这一节我们来复习一下shape2的用法：reshape2包的主要功能函数是melt（）和cast（），其实现了长数据和宽数据之间的转换。 melt的功能 用处：将列名作为行的...
