蛋白质互作网络(PPI) 蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号...
蛋白质互作网络(PPI) 蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号...
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百万映射读取的rea...
基本概念 表达趋势分析(Series Test of Cluster):将变化特征模式相似的基因归类到一种变化趋势中,从而找到实验变化过程中最具有代表性的基因集以及对应的趋势...
最近有一批转录组数据,其实不是时间序列的数据,而是从低到高有4个梯度的Al浓度处理的数据,每个三个重复,共有12个数据,想着看一下4个梯度处理下基因表达的模式,使用了STEM...
欢迎关注”生信修炼手册”! 实验设计对于转录组数据的分析是非常重要的,对于常规的case/control实验设计,通过两组间的差异检验就可以得到不同条件下的差异基因;对于多组...
欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2017/11/gene-cluster/共表达基因的寻找是转录组分析的一个部分,样品多可以使用WGCNA...
前不久小编接触了这样一个分析,给定基因表达矩阵后,通过自组织映射(Self-organizing map,SOM)技术识别其中的高表达基因集,以便和功能建立关联。 下文将该方...
富集分析是一种大家常用分析方法;msigdb数据库中有定义好的基因集,但其中绝大多数数据都是人类的;老鼠和其它物种的基因集有的,但是比较少,无法满足大众的需求。msigdbr...
本文摘自:R 语言主成分分析(PCA)实战教程[https://mp.weixin.qq.com/s/uQPCPh09XXQiz9Iau9p5Fg]方便个人学习和查阅 安装依...