请将问题描述清楚点
3K水稻SNP数据集的简单利用3010份亚洲稻群体重测序项目是由中国农业科学院作物科学研究所牵头,联合国际水稻研究所、华大基因等16家单位共同完成。该研究对来自89个国家的3,010份水稻品种进行了重测序...
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@ffad5e5017ac 国家水稻数据中心有常见品种种植区域,一般标在省会,其他国家不是很重要的品种标首都
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有分类信息的表格里有每个样本来源,IRRI下载列表,原始文献的补充材料列表里都有的。但是材料来源只有国家信息,具体经纬度要手工标注的,这个估计要花个4-5天时间,可以选择重要的样本,或者从其他文献的补充材料里找,国家水稻数据中心有部分样本的种植区域信息可以参考
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这个原因可能有很多需要看下报错才知道
TBtools:基因家族分析简单流程写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具。作者(CJchen-0410)在B站上有新手教程,大家可以给大神点个关注。 本文以《Genome-wide iden...
IRRI上还能下表型数据啊。
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我咋给你啊?
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哪个e value? 如果是hmm里的,一般认为要1e-5以下,但主要还是看你的做的结构域。
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前段时间送去测序的实验数据拿回来了,然后做完比对之后发现unique_reads比对率不够理想,确保分析数据过程中没有出错的前提下,个人认为实验过程中可能有污染。所以需...
纯粹就是记录下如何在Window下少写代码完成RNA-seq,并没有详细讲解转录组分析的原理和每一步背后的含义。想深入了解可以翻生信技能树,生信宝典,组学大讲堂等等公众号。本...
今天发现TBtools上有了个神器 Rserver 。这意味我们可以把别人写好的R脚本直接拿过来运行。于是用OneStepWGCNA这个插件试验一下。本文主要记录试验过程和可...
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