Sequence Logo是如何画出来的呢？ 作者：snail审稿：童蒙编辑：amethyst 计算PFM 还是以MEME example中第一个的Motif结果[https...
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Motif可视化——从PFM矩阵到sequence logo
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PyMol ：精准测量分子距离，让你的结构分析快人一步！榴莲忘返 2014 在结构生物学的世界里，原子间的距离决定着相互作用的强弱，也蕴藏着生命活动的奥秘。而 PyMol 作为一款功能强大的可视化软件，为我们打开了通往微观世界的大...
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CHIMERAX的使用通过Chimerax Userguide 和tutorial 的学习记录 基本鼠标操作 鼠标左键移动——默认旋转 鼠标滚轮——放大缩小 shift+ 鼠标左键移动 / ctr...
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【陪你学·生信】六、当你有一段待分析的氨基酸序列
这一推送将简单介绍： 1.寻找蛋白质结构域 2.简单预测序列的理化性质 4. 预测蛋白酶降解位点 5.预测卷曲螺旋区域（coiled-coil domains） 6. 预测翻...
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基因组重复序列检测：RepeatMasker的安装及使用RepeatMasker是重复序列检测的常用工具，通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列，属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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病毒正二十面体对称结构：病毒学常见概念 I
我对病毒学的喜爱，受先生影响。虽拜先生门下，但这些年与先生相处时间并不多。有时匆匆见一面，先生无意间提及的一个病毒学概念，我都会花不少时间去查阅资料，以加深印象。正如今天我要...
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用二代测序分析软件来跑一代的结果
2013年左右，二代测试开始崛起，不到一年大有横扫测序行业的势头。记得当时二代测序服务公司的业务员到我们实验室推销业务，宣传册十分“高大上”的样子，一问价格，内心直哆嗦。但当...
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RoseTTAFold-蛋白质预测的“平凡之路”在个人笔记本win10自带子linux系统下，运行基于CPU运算的RoseTTAFold 避开uniref30、BFD这两个超大数据包的下载及解压 提供便捷的pyRosett...
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干货 | 全基因组CRISPR文库筛选数据分析——MAGeCKFlute近年来，全基因组CRISPR文库筛选技术被广泛应用于肿瘤及病毒相关调控因子筛选。通过同时sgRNA文库同时敲除全基因组的不同基因，经流式或药物筛选目的细胞表型，并扩增sgRN...
