问题来源 今天合并两个表达矩阵的时候，使用impute包对矩阵补充缺失值的时候出现了这样的报错 解决思路 这时候其实就是把错误往谷歌里贴一下，看几个答案也就解决了，没注意代码...
发简信
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Error in storage.mode(x) <- "double" : (list) object cannot be coerced to type 'double'
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如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析如何分析芯片数据 我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而最近有一个学员在看生信技能树在...
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基因芯片批次效应处理
由于实验人员、技术、环境、时间点、芯片处理等各种因素原因，得到的芯片表达矩阵是含有非生物学因素差异的。有时候想分析两组间差异，但是一个数据集下面的样本数量略少，因此想整合多个...
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批次效应及多数据集合并
如何判断有批次效应 数据集中明确说明 Boxplot图 聚类树 PCA分析 芯片数据的处理 1.批次效应不能被消除，只有尽可能的降低。2.是否会矫枉过正？① 联合分析正常组为...
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DNA链方向上的小疑惑
虽然是做生物信息的，但是经常被一些基础性概念所困扰……而我又是一个强迫症，于是把这些乱七八糟的东西整理了一下，强行写了一篇小文章。东西太杂，但是彼此相关，实在想不到什么合适的...
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呦呦切克闹，WGCNA来一套刘小泽写于18.10.10很早就见过它，但只是不明觉厉，直到昨天才开始认真了解是这样的：昨天上午看了一篇文献，讲冠心病的基因共表达分析，简而言之就是把得到的几千个变化比较大的...
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ewas实验设计（文献阅读）本文为以下文献的笔记：Michels K B, Binder A M, Dedeurwaerder S, et al. Recommendations for the des...
