导读 平时看文章,特别是组学文章,作者在文末都会提供其研究材料中高通量测序数据的下载链接,如果平时想练手的话,下载这些数据是最好不过了,下面我就总结下如何从GEO和SRA中下...
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导读 平时看文章,特别是组学文章,作者在文末都会提供其研究材料中高通量测序数据的下载链接,如果平时想练手的话,下载这些数据是最好不过了,下面我就总结下如何从GEO和SRA中下...
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程开始,再去看原理。 为什么这么说呢,因为对于初学者来说,...
前言 俗话说“文献是最好的老师”,但是隔行如隔山,在科研界,隔着一个领域就有一个巨大的鸿沟。就比如就算做肿瘤研究的人,看免疫学领域的文章还是会头皮发麻,看到总是记不住的CD4...
clusterProfiler包是Y叔开发的一个强大的能进行多种功能富集的R包,对于有OrgDb或AnnotationHub中收录的物种进行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
1,参考脚本: nohup /home/zxd/software/trinityrnaseq-Trinity-v2.4.0/Trinity --seqType fq --ma...
写在前面 几乎每年的8月份,都是科研大神们比较关注的日子,因为自己年初苦心经营的基金申请结果即将揭晓。那么究竟花落谁家,其实早有定数(当然要建立在通宵达旦的码字以及契合审稿人...
本文是对前几天的打脸打脸之处就在于发现了muscle的R包,从此不用再为序列比对东奔西跑—— Step 1. 从基因名拿到序列 这一步用到的包:biomaRt ,选择用sym...