EM算法 leengsmile2016年9月24日 EM 算法 本文档介绍如何在R语言中,通过EM算法,估计高斯混合模型的参数。首先通过简单的例子,用简单的程序描述EM算法估...
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这方法大杂烩,有点玩赖啊
SC3 - consensus clustering of single-cell RNA-Seq dataSC3本质上来说还是k-means聚类,但是在聚类前后进行了一些特殊的操作。首先对原始数据进行基因过滤以及PCA或者laplacian变换降维,减少数据噪声聚聚类结果的影响。...
SC3本质上来说还是k-means聚类,但是在聚类前后进行了一些特殊的操作。首先对原始数据进行基因过滤以及PCA或者laplacian变换降维,减少数据噪声聚聚类结果的影响。...
写在前面 当前是人工智能的时代,各种机器学习的算法层出不穷,各种各样的AI不但在自我快速迭代发展,也在深刻地影响和改变着人们的生活。最近笔者在上一门机器学习的研究生课程,在完...
谱聚类(Spectral Clustering, SC), 是一种基于图论的聚类方法——将带权无向图划分为两个或两个以上的最优子图,使子图内部尽量相似,而子图间距离尽量距离...
介绍 一致性聚类是一种为确定数据集中可能的聚类的数量和成员提供定量证据的方法,例如作为微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用,在那里发现了新的疾病分子亚类。 ...
一文看懂火山图 火山图可用于展示两组样本间基因表达水平差异的分布状况。 横轴log2 fold change差异表达倍数(Fold Change值,简称FC,根据log2 f...
作者,追风少年i 周三了,好好学习,天天搬砖,人生没有倒带,前进才是真理 接上一篇,10X单细胞(10X空间转录组)通讯分析之总结Nichenet生态位通讯比较分析[http...
作者,追风少年i 马上中秋了,祝大家节日快乐,我们这一篇进行分析合集,回顾一下空间转录组的分析重点,包括8个部分 CellphoneDB V3.0 助力空间转录组生态位通讯分...
新的一周,新的开始,今天我们来分享一个cellphoneDB的升级版,CellphoneDB的V3.0版本,升级的最大改进在于服务于空间转录组的通讯分析,会结合空间位置和生态...
更多重要函数见:Seurat重要命令汇总[https://www.jianshu.com/p/104f9290af8b] Seurat绘图函数总结 在使用R语言进行单细胞数据...
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,储存受体、配体以及两种相互作用...
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,储存受体、配体以及两种相互作用...
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参考:https://satijalab.org/seurat/articles/essential_commands.html[https://satijalab.org/...