ChIP-seq数据分析实战训练(二) 四、过滤 raw data -> fastqc 使用trim_galore软件进行质控,过滤 过滤后的文件如下: clean data...
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ChIP-seq数据分析实战训练(三) 六、合并bam文件 在进行peaks calling的时候,需要把bam进行合并。 得到全新的bam文件如下: 假如需要去除PCR重...
ChIP-seq数据分析实战训练(一) 一、安装软件(conda) 二、下载数据 参考文献 Brookes, E. et al. Polycomb associates ge...
前言 Linux系统的基本操作,对于大多数计算机类相关学生或者相关从业人员都很重要,本文以树莓派的Linux系统为实例,从基础出发,详细介绍Linux系统中最基础的操作。 什...
有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
1数据获得 2 格式转换 3 质控 主要是看是否有接头序列 4. 去除接头 接头序列:GATCGGAAGAGCGGTTCAGCAGGAATGCCGAG 去除完接头最好再次质控...