我要不要继续更新呀。简书真的不错，尤其在markdown格式转化方面。求求别倒闭！
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【软件使用】PyMol入门教程主要讲述PyMOL中常见的图形界面（鼠标）操作 1.认识PyMol 1. 软件界面介绍 1.2 内置demo介绍 打开PyMOL,点击1.1菜单窗口的Wizard菜单，然后点...
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跟着Nature microbiology学画图~R语言ggtree展示进化树今天要模仿的图片来自于论文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...
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跟着Nature Communications学数据分析：R语言DESeq2包做otu差异丰度分析及火山图展示结果论文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试数据（还是以果蝇为例）。 一、...
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IGV导出SVG图片导入到AI里的方法
前言 从IGV里导出矢量图格式SVG，虽然可以直接用chrome查看，但是用AI打开编辑时会报错，并只剩下框架，没有各个tracks，如下图： 有些版本还会报带有Tiny的提...
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富集分析天花板之ClusterProfiler4说在前面 在国内做生信的小伙伴或多或少都听过一个大名鼎鼎的名字---Y叔，想当初小编初入生信大门时还专门百度查了一下，他就是南方医科大学生物信息学系主任余光创教授。Y叔在国际...
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在热图中标注出特定基因的名称对于基因的差异表达谱，常用热图作为展示。但有时差异基因可能非常的多，热图中不可能将所有基因的名称标注出来。那么此时不妨选择一些比较重要的基因（比方说p值最显著的那些），在图中...
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如何给热图heatmap添加指定的标签？当我们画热图（heatmap）的时候，如果基因的名字比较多的时候，在热图中展示的话，就会出现名字重叠的情况，针对这个情况，我们有两种比较好的解决办法，第一是在热图中仅显示关注...
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pheatmap热图技巧合集突然间发现，我一做热图就用pheatmap几乎不存在第二个选项了。是时候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一个值得注意的参数，它旨在说明你想...
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跟着PNAS学画图：R语言ggplot2分组添加拟合曲线论文 https://www.pnas.org/content/118/20/e2010588118[https://www.pnas.org/content/118/20/...
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bcftools 处理vcf文件，寻找多个vcf文件中突变的交集
目标 通过varscan等找到somatic mutations之后，想看多个样本的突变之间的交集。bcftools是用来处理vcf文件，可以进行各种相关的处理和分析。 软件...
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SnpEff使用方法
SnpEff使用方法 SnpEff 软件通过基因组结构注释数据（GTF文件），对VCF文件中的SNP/InDel信息进行注释，即主要解释了SNP/InDel是否能够对编码蛋白...
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如何在mac终端进入外插移动硬盘？
步骤如下： 1，在Mac中进入终端界面； 2，输入$ cd ../ （注意：cd后面有一个空格）； 3，确保处于进入了 "/" 目录，若不是，请继续输入$ cd ../ 4，...
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bcftools常用命令总结
bcftools是一个用于检测突变和处理vcf（variant call format）、bcf（vcf对应的二进制形式）文件的工具。虽然bcftools的大部分命令都可以直...
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最全bcftools使用说明--只看本文就够了1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合，它可以用于处理VCF文件和二进制的BCF文件。它可以接受VCF格式、压缩的VCF格式以及BCF格式，并能自动检测输入的格...
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文献中的热图代码实现（热图标记感兴趣的基因,基础知识）hello，大家好，今天我们来实现一下下面的这张热图 我们最关注的就是图的右边只标记感兴趣的基因，如何实现呢？？？ 准备作图文件 接下来，让我们来实现一下上面的热图。 为了绘...
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CRISPR-Cas gRNA设计到底该选哪个工具？？
自从开始分享自己的CRISPR-Cas9学习笔记和记录之后，收到了很多很有用的Tips以及一些未曾思考过的问题。分享学习笔记是一个非常好的学习方法，因每个人的背景知识、思维逻...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从fastq测序数据到OTU table笔记内容：由二代测序产生的序列数据（fastq格式）到物种丰度的OTU table， 样本群落距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的分析结果，为常规分析流程。...
个人介绍
抓娃娃大赛全国十六强
细胞生物学博士
努力💪学习生物信息ing~
博士期间研究方向：昆虫嗅觉感受，性信息素合成的分子机制；
博后现阶段研究方向：蚊媒病毒神经细胞嗜性的细胞分子机制
欢迎关注公众号：我们一起学生信
细胞生物学博士
努力💪学习生物信息ing~
博士期间研究方向：昆虫嗅觉感受，性信息素合成的分子机制；
博后现阶段研究方向：蚊媒病毒神经细胞嗜性的细胞分子机制
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