青橙123

雷达图绘制 （1）ggplot2简约版雷达图 library(ggplot2) dt = data.frame(A2 = c(0, 3.33, 3.25, 2.29, 0,2...

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基因家族生物信息学分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通过基因复制进行物种特异性扩增，主要有染色体片段复制、串联复制和反转录子转座等三种形式，可能导致功能丢...

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基因组注释主要包括四个方面： 重复序列识别 序列比对方法 RepeatScout、LTR-finder、Tendem Repeat Finder、Piler、Repe...

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在基因组注释中第一步就是重复序列的屏蔽，目前常用的从头注释pipeline就是RepeatModeler + RepeatMasker。 1. 软件安装 RepeatMask...

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在基因组注释中，预测基因结构是最核心的一环，在众多的从头预测软件中，augustus应用较广。但是由于安装过程依赖软件较多，如果没有管理员权限一般不要轻易尝试，有兴趣可以参考...

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WGCNA rm(list = ls()) #加载R包 library(WGCNA) library(tidyr) library(ggplot2) library(grid...

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edgeR 主要是利用了多组实验的精确统计模型或者适用于多因素复杂实验的广义线性模型。 前者叫做“经典edgeR”， 后者叫做”广义线性模型 edgeR“。 定义的read数...

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单细胞转录组测序方法详解 1 Smart-seq2（扩增全长转录组） 通过ployT抓取，只能检测mRNA。 Smart-seq2步骤: 1通过ployT抓取，加入SMART...

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尽管时间只有20多年，生物工程已发展成一个庞大的体系，按照传统的说法（尽管这个传统也不过20年），生物技术主要包括细胞工程、遗传工程、发酵工程、酶工程这四大支柱。推广开来，生...

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Python入门四+小部分linux

序列是对列表、元组、字符串的统称。 Python中的字典指的是Perl中的哈希，字典使用{}进行定义，每一对键值组合称为项。 集合：唯一性，无序性（即不能通过索引集中中的某一...

陈洪瑜

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Python入门三

收集参数又叫可变参数。仅需在参数前边加上星号（*）即可。除了打包外还可以解包，解包指的是对实际参数的解包，只需在前面加一个*即可，如test（*a）。 Python的所有函数...

陈洪瑜

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青橙123

收集参数又叫可变参数。仅需在参数前边加上星号（*）即可。除了打包外还可以解包，解包指的是对实际参数的解包，只需在前面加一个*即可，如test（*a）。 Python的所有函数...

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Python入门二

数组的概念指的是把一大堆同种类型的数据放在一块，通过下标进行索引，但数据必须是同种内型，Python没有数组，但是有列表，可以包含多种类型的数据。 向列表中添加元素可以使用a...

陈洪瑜

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青橙123

明明每个字都认识😟放一起完全不懂😲😲😲🌚

Python入门二

数组的概念指的是把一大堆同种类型的数据放在一块，通过下标进行索引，但数据必须是同种内型，Python没有数组，但是有列表，可以包含多种类型的数据。 向列表中添加元素可以使用a...

陈洪瑜

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青橙123

数组的概念指的是把一大堆同种类型的数据放在一块，通过下标进行索引，但数据必须是同种内型，Python没有数组，但是有列表，可以包含多种类型的数据。 向列表中添加元素可以使用a...