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1.常规下载方式:prefetch 对于常规下载sra数据来说,NCBI提供了它自己的一套工具(SRA-Toolkit),其中用prefetch来下载数据,用fast...
单细胞数据的导入与质控 - Seurat - 简书[https://www.jianshu.com/p/37d2e8d68c91]
###################################### 题目:单细胞数据的导入与质控 - Seurat 语言:R Author: YQ#########...
作者:尧小飞审稿:童蒙编辑:angelica 引言 在第一篇单细胞转录组(Single cell RNA)概述[https://www.jianshu.com/p/a50d3...
简介 Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析。Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型...
在这一章你将会学到: 构建质控指标并使用相关图像可视化数据质量 估算质控指标并设置阈值去除低质量的细胞 单细胞数据分析流程的每个步骤都有这自己的目标和挑战。对于我们原始计数数...