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  • 我没有看到过Seurat对细胞数的要求,Seurat是可以处理smart-seq2的数据的。建议试试分析看下结果。

    单细胞转录组测序分析--初探Seurat

    单细胞转录组测序--闲言碎语 时代发展的步伐总是毫不留情的将你甩在身后,连车尾灯都看不见。当你还在沉迷于普通转录组数据挖掘时,已经有人悄悄的搞上单细胞了。单细胞转录组测序,顾...

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    真核生物mRNA测序

    一、真核生物mRNA的结构: 二、建库方式:真核生物mRNA含有poly-A尾,因此最常用的富集真核生物mRNA的方法就是采用附着poly-T oligo的磁珠从total ...

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    简化基因组甲基化测序

    什么是DNA甲基化?DNA methylation:指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。为DNA化学修饰的一种形式,...

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    16S rRNA基因测序--微生物多样性分析

    什么是16S rRNA?16S rRNA是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分,长度约为1542nt,具有高度的保守性和特异性。16S rRNA基因是细菌上编码rRNA相对...

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    ATACseq--染色质开放性测序

    ATAC-seq:利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术染色体/质结构:细胞核DNA与组蛋白相结合,DNA缠绕在组蛋白上形成串珠式结构,因此染色质结构高度折叠(压缩)。...

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    T细胞受体库测序

    T细胞受体是T细胞识别靶细胞表面特异性抗原的蛋白分子,由α链和β链(分别由TRA和TRB编码)或者γ链和δ 链(分别由TRG和TRD编码)构成的异二聚体,主要是以α链和β链构...

  • 请问你说的细胞来源分类指的是什么?tsne图呈现的是细胞在二维空间的分布图,相邻的细胞基因表达模式相似,可以很好的查看聚类结果是否正常。

    单细胞转录组测序分析--初探Seurat

    单细胞转录组测序--闲言碎语 时代发展的步伐总是毫不留情的将你甩在身后,连车尾灯都看不见。当你还在沉迷于普通转录组数据挖掘时,已经有人悄悄的搞上单细胞了。单细胞转录组测序,顾...

  • 我代码贴错了,已经改过来了,谢谢提醒

    单细胞转录组测序分析--再说Seurat

    上期我们讲了使用Seurat分析单个样本,那么2个或多个样本的分析会有哪些不同呢?单细胞转录组数据中一个重要的问题就在于批次效应,任何一个试验步骤都容易带来批次效应,多个样本...

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    单细胞转录组测序分析--再说Seurat

    上期我们讲了使用Seurat分析单个样本,那么2个或多个样本的分析会有哪些不同呢?单细胞转录组数据中一个重要的问题就在于批次效应,任何一个试验步骤都容易带来批次效应,多个样本...

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    单细胞转录组测序分析--初探Seurat

    单细胞转录组测序--闲言碎语 时代发展的步伐总是毫不留情的将你甩在身后,连车尾灯都看不见。当你还在沉迷于普通转录组数据挖掘时,已经有人悄悄的搞上单细胞了。单细胞转录组测序,顾...

  • 放下你的焦虑

    春节假期终于还是快要结束了,多想给生活来个暂停键,放下匆忙的脚步还有那焦虑不安的内心。已经记不清多少次自己心不在焉的时候了,脑海里总是时不时的冒出与当下无关的未来焦虑。我到底...

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    五年之后

    五年之后 前几天在一篇文章中看到一个问题,五年之后,你会成为什么样子?这是一个有趣的话题,五年,人生有多少个五年呢?在人生长河中,你是否又有过自己的五年规划呢?还记得...

  • 话说这一年

    这次,真的很久没有写东西了,都快记不清上次写字是什么时候了。借2016年的最后一天,给自己一个仪式,来写下这篇文字,回忆今年发生的故事。 2016年,依然平凡,真...