synvisio在线工具 链接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.github.io/]之前知道这个工具,但是没有搞懂...
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在自然群体(区别于强人工选择)中,如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性,随着环境变量的改变而变化,则这些环境变量往往反映了环境作用于个体表型的选择...
1、minimap2 Minimap2 is a fast sequence mapping and alignment program that can find over...
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析,没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
ideogram(三) 4、ideogram 修剪 如果你不想绘制整条染色体,则可以选择创建一个轴断点并从中删除一个区域 可以通过两种方法实现: 指定要绘制的内容 指定不要绘...
一,安装circos 二,数据准备 1,计算染色体长度 2,生成染色体文件 7列 karyotype.txt 3, 生成窗口文件 每50k一个窗口 4,计算每个窗口平均GC...
写在前面 因为我研究的物种比较小众,很多注释不完全,R包AnnotationHub中也没有对应信息,所以无法使用公共数据库进行kegg富集分析。所以自己尝试使用KAAS造一个...
在此介绍一个可直接筛选的脚本select_longest_transcripts.pl 重点改写第25, 28, 31, 64正则匹配.gff文件和.cds文件里的信息 筛选...
由于忙课题的原因,断更了好久,虽然断更的时间内学习到了很多东西,但细想一下还是记录在自己博客里比较好,方便自己查阅也方便其他人学习 JCVI这个软件网上有太多教程,再记录一次...