列举了19个OrgDB，物种对应的全基因组注释R包，方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等 | 物种 | OrgDB || 按蚊（Anopheles） | org.Ag....
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常见的OrgDB包，方便对应物种注释
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跟着Nature ecology and evolution学python：vcf文件转换成fasta文件论文 A polar bear paleogenome reveals extensive ancient gene flow from polar bears into b...
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Ribo-seq实验总结
Ribosome profiling是一种新出现的实验技术，它结合了高通量测序技术的应用，可以在全基因组水平上监测蛋白质的翻译水平，给研究细胞内蛋白质的翻译调控机制带来了新的...
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跟着Nature Metabolism学作图:R语言ggplot2分组折线图添加误差线论文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
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生信 | 生信人搭建数据库的学习流程
写在前面 目前各种组学培训开展的如火如荼，却鲜有生物信息学数据库搭建的相关教程和学习流程。原因有以下几个： 1.学习数据库的搭建付出多，回报少。有这功夫应该可以把大部分组学知...
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2021-08-22 tRNA m7G修饰促进肿瘤转化tRNA作为蛋白质翻译中氨基酸的转运小能手，发挥着至关重要的作用。而另一个有关tRNA的特殊之处在于其及其丰富的修饰数量与类型。一个成熟的tRNA仅约72nt，平均每个t...
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12-19 利用高通量tRNA测序和调控分析描绘微生物组群特征Microbiome characterization by high-throughput transfer RNA sequencing and modification...
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2021-04-20 各种tRNA测序方法tRNA相关研究似乎由于近些年tsRNA的发现才又引起大家的关注，另一个原因可能也与当前RNA表观遗传研究相关。 tRNA作为生物体内修饰最为丰富的RNA，加上其本身容易形成...
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STAR和PIPE-CLIP对clip-seq数据call peak突变率极低的bug捣鼓两天才搞明白的bug： bug1表现形式： 1 clip-seq数据突变比率严重下讲 2 缺失substitution和deletion类型的...
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R Shiny 进阶.1 多页面排版和自定义图形主题学习本章会解锁新技能。如何布局layout。 1. 单页面 1.1 页面功能 fluidPage()[https://rdrr.io/pkg/shiny/man/fluidP...
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具有Shiny和数据库的企业级仪表板在企业内部，仪表板应该具有最新信息，尽管有大量数据支持它，但在任何设备上都可以获得快速响应时间。最终用户可能希望单击图中的条形图或列将导致更详细的报告或构成该编号的实际记录列...
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网络-visNetwork包绘制炫酷的动态网络图visNetwork是一个用于网络可视化的R包，使用的是vis.js javascript库(http://visjs.org[http://visjs.org])。visN...
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打包你的脚本，做成个有图形界面的程序吧！最近想把一个写的几百行的脚本封装成一个App，方便使用，于是进行了一番探索，在这里记录一下！ 方案选择 首先是搜索有哪几种解决方案，哪个是最好的呢。搜索下来发现，有这么几种：...
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在raw data boxplot前倒下的多天以后爬到了PCAFanta sea, totally shiny-seq 复现 https://www.rna-seqblog.com/shiny-seq-advanced-guided-t...
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盘点强大的shinyUI美化包从前只知道shiny和shinydashboard，开发简单的网页是够的，但一旦对颜值有了要求，就不能对html和css丝毫不知。关于shiny与CSS：https://sh...
