安装本地blast序列比对软件，我们可以搜索一个查询序列定制数据库，例如想研究一个新测序的基因组，或者感兴趣的一组蛋白质序列。有时我们希望把程序插入到一个流程中，例如搜索一个...
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linux BLAST序列比对
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seqkit：fasta/fastq序列统计小工具帮助文档 https://bioinf.shenwei.me/seqkit/[https://bioinf.shenwei.me/seqkit/] 安装我直接使用conda安...
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转录组测序6-基因GO、KEGG、GSEA富集
转录组测序是最常用的组学实验，对全谱基因定量，找到差异表达基因。RNAseq涉及到原始数据，数据质控，基因组比对，差异基因鉴定，差异基因功能富集分析，重要基因如转录因子激酶的...
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RNA-seq学习：No.4下游分析之DEseq2包差异分析基于上游分析获得表达矩阵后，就可以进行差异分析了，最基础的莫过于利用DEseq2包寻找差异基因。学习自b站视频生信技能树转录组视频~ 0、数据准备及前处理 由于目前在家不方便...
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「蛋白注释」- 批量InterProScan注释
Mar 20,2020 更新！ 什么是InterProScan数据库 InterPro provides functional analysis of proteins by...
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基于blast进行GO功能注释
目前GO注释主要分为两种方法，其一，序列相似性即blast，其二，结构域相似性比对（InterProsScan），该方法在前面也提及过，本文就blast进行简要概述 所需文件...
