软件准备：GeneDoc下载地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
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利用GeneDoc美化同源比对结果 -
使用MAKER进行基因注释(高级篇之GeneMark-ET模型训练）GeneMarkGeorgia Institute of Technology开发的一系列基因预测工具。真核生物基因组预测主要会用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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使用MAKER进行基因注释(高级篇之SNAP模型训练）
训练 ab initio 基因预测工具(以SNAP为例) 对于一个新的物种而言，你大概率是没有一个高质量的基因模型去进行基因预测。但是我们可以利用EST序列（少部分物种估计有...
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maker注释篇二(ID转换)
基于上一步我们获得了初步的gff及rna和蛋白文件，maker生成的文件id是默认的，我们可以用maker自带的脚本进行更改。 生成maker默认id和需要改的id的对应关系...
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2020-09-07 MAKER Turorial 2013
关于MAKER MAKER是一款易于使用的基因组注释管道软件，在小型或大型科研项目都适于使用。MAKER既可用于对于新研究生物基因组进行de novo注释以为更新注释提供证据...
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基因注释：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本为3.01.04 第一轮：将已知基因比对到基因组 包括两个部分：🔸屏蔽重复序列🔸将已知的转录组/蛋白序列与基因组进行比对 1.（可选）构建自定义重复序列...
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基因注释：MAKER3安装（非root）
在该页面登记后会弹出下载链接：http://weatherby.genetics.utah.edu/cgi-bin/registration/maker_license.cg...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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蛋白质序列比对与蛋白质二级结构预测#什么是蛋白质二级结构？ 按照结构层次划分，蛋白质结构可以分为一级结构、二级结构、三级结构、四级结构： 蛋白质二级结构（secondary structure of prot...
