简介 plot1cell包提供了多种单细胞数据可视化的高级功能,可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图,主要依赖于Seurat V4,circlize,Compl...
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简介 plot1cell包提供了多种单细胞数据可视化的高级功能,可以基于Seurat分析结果对象直接进行可视化绘图,主要依赖于Seurat V4,circlize,Compl...
一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。ScaleData()[http...
WGCNA笔记第三弹 WGCNA分析原理 WGCNA应用场景 WGCNA分析实践 本代码借鉴了生信技能树的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA课程编写,转载请注明出...
前言 目前的课题是10X单细胞测序(植物方面),之前已经把所有的流程基本走过一遍,现在就将自己的学习过程整理成笔记给大家分享一下,我在学习单细胞分析的时候主要跟着单细胞天地的...
生信技能树单细胞数据挖掘笔记(1):数据读入[https://www.zhouxiaozhao.cn/2020/10/24/ScRNAseq(7)/] 生信技能树单细胞数据挖...
前言 本次主要使用Seurat比较STAR与Cellranger的输出结果,只会进行简单的聚类工作。 数据读入 数据比较 根据箱线图,直方图和矩阵的基本信息,可以看到STAR...
前言 最近有幸加入生信技能树的单细胞数据挖掘尝鲜群[https://mp.weixin.qq.com/s/3XyA-DXRzL8JuJlnV3LW0Q],借此机会给大家分享一...
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