在进行GWAS分析之后呢，我们通常会通过LD clumpping得到lead SNP，然而这些lead SNP在基因组中会与其他SNP有比较强烈的连锁，这时就需要我们以图的形...
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2025-05-02 | GWAS分析-包含LD信息的Locuszoom图的绘制 -
跟着Nature Communications学作图：R语言ggtern包画三元相图（Ternary plots ）论文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
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文献分享 | Nat Genet：常见 SNP 可以解释人类身高的大部分遗传因素●英文题目：《Common SNPs explain a large proportion of the heritability for human height》 ●期刊...
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组会论文 | Nat Genet：大规模多性状全基因组关联分析鉴定数百个青光眼风险位点《Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundreds of glaucoma ...
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2024-11-30 | 群体遗传变异——SNP及INDEL calling进行群体遗传学分析的前提是我们得得到变异信息，之前已经介绍了如何进行CNV的识别，那么本文来介绍下如何识别基因组中分布更多、更常见的变异SNP（INDEL顺带） 二代测序 r...
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2024-10-16 | GWAS数据SNP rsID的注释
当我们拿到某个研究的GWAS summary data时，因为大多是二代测序的缘故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我们下游有些分析却要用到rsid，这时我们会...
