前两天释放了一个插件，名为「CLI Program Wrapper Creator」，可用于打包所有软件，脚本程序，分析流程为「界面化工具」。打包「界面化工具」，益处如下： ...
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视频 | 无需编程！手把手教你制作「界面化软件」，打包所有可用软件、python/perl/R脚本 -
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GTF处理脚本 - GTFtoolsGTFtools：一个灵活而强大的GTF文件处理工具 GTFtools是一款用Python编写的命令行工具，专门用于处理基因转录格式（GTF）文件。GTF文件是一种用于描述基...
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即日起「TBtools」关闭「高速插件商店」，让往事随风~终于还是走到这一步，思来索去，我还是决定，直接「关闭」TBtools的「高速插件商店」。当然，这对应了两个事情： TBtools 插件商店中又少了一个条目。「高速插件商店」本...
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Minimap2（2.20）使用记录
文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://github.com/lh3/minimap2#general[https://github...
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TCGA所有projects的信息
点击查看，可以下载到自己本地 TCGA_projects:https://docs.qq.com/document/DYmtyanJwa3RDeW9T[https://doc...
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R包TCGAbiolinks获取TCGA所有projects的信息可以使用 R 包 TCGAbiolinks 来获取 TCGA 癌症临床信息 信息保存在projects.xlsx文件中，查看projects.xlsx (部分内容预览)：我保...
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awk 中的 BEGIN 和 END 的用法
awk中两个特别的表达式，BEGIN和END。 这两者都可用于pattern中，提供BEGIN和END的作用是给程序赋予初始状态和在程序结束之后执行一些扫尾的工作。 任何在B...
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【Seurat 官方教程】流程拆解 (一): 预处理（过滤细胞和标准化）
官网教程：外周血单个核细胞数据集 Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC)[https://satijalab.org/seurat...
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Orthofinder 2.3Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源，是指不同物种之间的基因，起源于共同的祖先，基因功能可能一样，但又因为进化的关系，使得功能有...
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差异可变剪接软件哪家强？
作者： 童 蒙编辑：amethyst 可变剪接作为转录后修饰的重要环节，对细胞的活性和疾病的发生发展都有广泛的作用。尽管目前软件很多，但是软件间的比较却比较少。作者系统地...
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终止释放-20210320 - Free！公益释放 | 任何人都能分析 RNAseq 原始数据了，只要你用 TBtools ！写在前面 六年前，我着实开发 TBtools 的主要目的之一，即“减轻科研人员数据分析负担”，而后慢慢变化成现在的“降低甚至拆除部分生物信息学数据分析门槛”。基于这三五年的观...
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如何将简单的问题整复杂……fasta序列长度筛选写在前面 看到一个问题，如何筛选fasta文件中基因序列长度，当时脑子里想到了最近正在学的东西。如何在linux下一行指令筛选fasta文件中序列长度低于200的序列。 命令...
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基因家族鉴定流程（二） 用blast、mmseqs、diamond、hmmer搜索同源蛋白本文章将介绍 ①类blast软件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比较 ②blast、mmseqs、diamond、hmmer的使用 ③用四种软件的实践操...
