4.字符串 4.1 转义字符 4.2 字符串格式化 4.2.1 百分号（%） 4.2.2 元组的字符串格式化 占位符个数和元组个数要相等； 若使用列表代替元组，列表仅代表一个...
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4.python字符串
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3.python元组
3.元组 Python的元组与列表类似，不同之处在于元组的元素不能修改（前面多次提到的字符串也是不能修改的）。创建元组的方法很简单：如果你使用逗号分隔了一些值，就会自动创建元...
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2.python列表
2. 列表 不同于元组和字符串，列表的内容是可变的（mutable）。 2.1 更新列表 2.1.1 元素赋值 ①简单赋值（同R） ②报错情况（R可以） 不能为一个不存在元素...
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1.python序列
1.通用序列操作（P48） 1.1 索引（正数索引同R向量，负数索引R为删除） 1.2 分片 1.2.1 定义student 1.2.2 正数分片（同R） 1.2.3 负数分...
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请问样本整合之前需要先过滤细胞吗
Seurat的三种单细胞数据整合方法汇总（批次校正）2022-05-24
关键词 批次效应 批次校正 单细胞数据整合 适用背景 单细胞数据由于实验平台或样本等原因会造成不同数据集之间存在批次效应，这种批次效应是人为因素造成的，没有实际的生物学意义，...
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请问整合之前为啥不先过滤细胞
seurat单细胞转录组整合分析教程-01
前段时间跟师兄聊天，聊到seurat包，他说学软件一定要知道这个软件开发的目的，它是要解决哪些主要问题，哪些是次要问题，次要问题其他R包同样解决，他开发的主线是什么。单细胞多...
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您好，请问多个样本整合之前需要先过滤细胞吗
10X单细胞（10X空间转录组）整合分析之nature文献思路整理
hello，大家好，今天来分享一篇nature文献的10X单细胞样本整合分析的方法，关于多样本整合分析，之前我的公开课和宣讲课讲了很多，听过的都应该有一些整合的思路，今天我们...
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您好，整合之前不需要先对细胞进行过滤吗
单细胞多样本整合分析
代码主要来自：https://satijalab.org/seurat/articles/integration_introduction.html[https://sati...
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答疑| ggplot 绘制火山图并添加文字标签
答疑|火山图加文字标签 后台有几个同学对之前的教程跟着CELL学作图|1.火山图[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIxMDExNDE0OQ...
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方差分析、T检验、卡方分析如何区分？差异研究的目的在于比较两组数据或多组数据之间的差异，通常包括以下几类分析方法，分别是方差分析、T检验和卡方检验。 三个方法的区别 其实核心的区别在于：数据类型不一样。如果是定...
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使用R语言进行卡方检验（chi-square test）文|程瑞林（山东大学第二医院足踝外科）来源|（微信公众号）云中瑞麟（ID：ruilinfly） 瑞麟导读：对于计量资料，临床医学研究中常用的统计分析方法是t检验；而对于计数资...
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用R语言进行相关性分析：画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值一. 读取数据 因为我们一般自己录的数据都是excel表格的，对于读取excel，此处有一个小技巧 读取excel方法 1.把excel文件另存为CSV文件 2.按照读取cs...
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堆叠柱状图各成分连线画图的R脚本18年1月29日宏基因组转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...
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微生物多样研究—差异分析1. 随机森林模型 随机森林是一种基于决策树（Decisiontree）的高效的机器学习算法，可以用于对样本进行分类（Classification），也可以用于回归分析（Re...
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微生物多样研究—微生物深度分析概述
一、微生物深度分析方法核心思想 复杂微生物群落解构的核心思想： 不预设任何假定，客观地观测整个微生物组所发生的一系列结构性变化特征，最终识别出与疾病或所关注的表型相关的关键微...
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Pilon | 基因组纠错
前言 三代测序错误率比较高，一般组装后需要进行纠错来提高准确度。本次介绍使用Pilon通过引入二代测序数据来对三代基因组进行纠错。 Pilon官网 Pilon软件安装 Pil...
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RNAseq 必读综述和在线教程最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简要整理并对相关评论内容进行大致翻译，供国内读者参考。 两篇综...
