AlphaGenome: advancing regulatory variant effect prediction with a unified DNA sequence...
发简信
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文献分享——AlphaGenome: advancing regulatory variant effect prediction with a unified DNA sequence model -
p5和p7都有可能连接到flowcell上呀，您看一下示例图
基础知识——illumina测序原理
二、高通量测序---illumina测序原理 高通量测序技术（High-throughput sequencing）以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般...
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基础知识——连锁不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一、概念 连锁不平衡是指,在某一群体中，分属两个或两个以上基因座的等位基因同时出现在一条染色体上的几率，高于随机出现的频率。连锁不平衡是等位基因或者遗传标记在一个种群中表现出...
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常用GWAS统计方法和模型简介本文是百迈客GWAS生物信息培训课程学习笔记第二篇，第一篇请参考GWAS基本分析内容 这里首先介绍了GWAS分析中常用的统计学概念： 1. 假设检验 零假设(H0,null ...
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软件安装——VMware安装，创建Ubuntu虚拟机(Windows)part 1 VMware安装 一、VMware简介 VMware,lnc(Virtual Machine ware)是虚拟PC软件公司，提供服务器，桌面虚拟化解决方案。 主...
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TiED:人类组织特异性增强子数据库
欢迎关注”生信修炼手册”! TiED是一个人类增强子数据库，对10种不同组织中的增强子表进行定量和分析，鉴定了增强子的组织特异性，网址如下 http://lcbb.swjtu...
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文献分享——Chromatin interaction neural network (ChINN): a ...Chromatin interaction neural network (ChINN): a machine learning-based method for predi...
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截取序列时截取等长片段
软件学习——模体搜索MEME-ChIP
The MEME suite 是一组功能强大的，基于网页的集成工具，可用于研究蛋白质，DNA 和 RNA 中的序列模体。 The MEME Suitehttps://meme...
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Juicer:Hi-C数据处理分析（一）参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
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科研绘图软件——Graphad PrismGraphad Prism(8.0) 一、软件简介 这是一款非常好用且功能强大的科研医学生物数据处理绘图软件，也可对数据进行统计分析。 官方网站 https://www.gr...
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基础知识——第三代测序技术三、第三代测序技术 一、单分子荧光测序 1.1测序平台 Pacific Biosciences 公司，简称为PacBio,这是目前为止，读长最长的下一代测序技术公司。 读长最...
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基础知识——Linux下常用命令
Linux下常用命令 目录相关命令 命令 功能 pwd显示当前路径mkdir创建空目录ls显示列表rm删除文件rm -r删除非空目录rm -rf清空所有，谨慎使用cd进入某...
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基础知识——基因结构基因（遗传因子） 是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。带有遗传信息的DNA片段称为基因。(百度百科)[https://baike.baidu.com/item/...
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基础知识——illumina测序原理二、高通量测序---illumina测序原理 高通量测序技术（High-throughput sequencing）以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般...
