一、需要的数据 (1)eggnog对基因的注释(名字例如叫:egg.tsv) TSV格式 (2)ko00001.json文件 下载地址:https://www.genome....
近日,帮女朋友画截断图时,遇到了一些问题,网上很多资料都是互相粘贴,缺少能够解决问题的帖子,经过查看官方api最终解决了问题。在此记录一下,也希望能够帮助其他有需要的人。 b...
谈谈本体论 为什么需要本体论 作为一位大学统计棉花表皮毛的苦逼生物狗,深刻体会什么叫做经验,也就是人类模式识别能力的强大和不精确性。当时的导师教我如何根据表皮毛的长短和浓密进...
首先,基因本体论(Gene Ontology)和基因文库不是同一概念。 我从下面几个方面讲一下GO的一些概 念和基本方法(感谢刘老师提供的资料): 1. Ontology(本...
@六六_ryx 好吧!谢了!
STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
你好!我在提取单个模块的hub基因时,提取出的基因竟然不属于该模块。这种可能是什么原因?谢谢!
STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
@莫逆于心_c101还没有,不知道后面该怎么弄
测序了,然后呢(四)有了OrgDb才能进行富集分析刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系,以及基因与G...
@生信小白2018 你好,这个问题你有解决吗“Error in attributes(.Data) <- c(attributes(.Data), attrib) :
'names' attribute [434046] must be the same length as the vector [4]
In addition: Warning messages:”
测序了,然后呢(四)有了OrgDb才能进行富集分析刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系,以及基因与G...
楼主,我在跑代码时。到step4-2时,代码运行后无反应,这是什么情况?
测序了,然后呢(四)有了OrgDb才能进行富集分析刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系,以及基因与G...