男，某西北高校博士在读，摸鱼专业户。
发简信
IP属地：浙江
-
-
你好，想问一下在运行gubbins时候出现以下问题最后显示Failed while building the tree.是什么原因呀？
Constructing the phylogenetic tree with raxmlHPC-AVX2...
raxmlHPC-AVX2 -safe -m GTRGAMMA -f d -p 1 -s /public/home/st39/ssq/first/result/clean.full.aln.phylip -n clean.full.iteration_1 > /dev/null 2>&1
Failed while building the tree.使用Snippy构建细菌基因组SNP、core SNP和系统进化分析
snippy[https://github.com/tseemann/snippy] 是澳大利亚墨尔本大学的 Torsten Seemann[https://twitter....
-
你好，想问一下在运行gubbins时候出现以下问题最后显示Failed while building the tree.是什么原因呀？
Constructing the phylogenetic tree with raxmlHPC-AVX2...
raxmlHPC-AVX2 -safe -m GTRGAMMA -f d -p 1 -s /public/home/st39/ssq/first/result/clean.full.aln.phylip -n clean.full.iteration_1 > /dev/null 2>&1
Failed while building the tree.我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚类分析流程
个人进行SNP分析用的软件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]，主要是可以一次批量完成。准备工作：1.待分析的序列文件（fa...
-
-
经典：基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理原作者：https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11596253.html https://www.cnblogs.com/leezx/p/5590...
-
R: 距离，聚类，建树R有自己的计算样本距离(dist)和聚类(hclust)的方法/函数，各自包含多种算法据数据特征选择。另外在生态学vegan包vegdist函数也可计算距离，包含多种生态常用...
-
如果你是程序员，或者有一颗喜欢写程序的心，喜欢分享技术干货、项目经验、程序员日常囧事等等，欢迎投稿《程序员》专题。 专题主编：小彤花园 http://www.jianshu.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序员】专题拒稿指北：http://www.jianshu.com/p/7c8b33b5f63b 投稿须知： 1.收录相关技术文章，但不限于技术，也可以是项目经验类的文章和程序员日常。 2.文章內不得有任何推广信息。包括但不限于公众号、微博、微信，更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。你可以将这些推广以及个人信息放在个人主页介绍里。 3.字数极少，段落混乱，大段代码没有放到代码框的文章不收录 4.不相关的内容不收录，请确认文章内容和本专题相关 目前针对优质作者及爱好者，开设了官方程序员微信群，希望加入请发简信给主编小彤花园索取个人微信，主编会将你加入到【程序员】微信群，分享内容，收获知识。添加微信时备注昵称。
-
-
全基因组重测序基础及高级分析知识汇总
转自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因组重测序是通过对已有参考序列（...
-
-
生信人应该这样学R语言--Jimmy，20讲积跬步，至千里 1.介绍R语言及RStudio 1.1 安装R 包和Rstudio1.2Rstudio四个区块，区块，history（to source，to console...
-
黑客的操作系统
-
Linux思维导图整理前段时间整理了一个Java的思导图，今天整理了一下收集的Linux思维导图。 PS.图片都是在学习中或者偶然看到的，感谢感谢，因此我会附上图片的来源，如有侵权，请联系我，谢谢...
