这次学习的是单细胞测序的第三个比较常用的包:Scater。本文主要参考教程:单细胞转录组学习笔记-15-利用scRNAseq包学习scater来走分析流程。 scater包的...
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概述 最近在做一个开源的Web IDE项目,阅读了很多源码,为了更方便地使用一些开源模块,把项目从vue转到了react,很多地方来回来去写了好几版。我个人非常喜欢在线的ID...
写在前面 用过 BLAST 进行基因功能注释的朋友应该常常遇到两个问题: BLAST 输出格式较多,选择哪一类输出格式更为实用? 输出结果信息较多,如果方便下游数据分析? B...
写在前面 全基因组层面可视化特征标记(如基因位点),从文字标签到图形标签。文字标签应该是三四年前实现的。图形标签,Emmm,事实上,这个功能已经实现了太久,以至于我自己只记得...
感谢CJ大神的反复修改,这个功能越变越好了!本文旨在复现CJ大神推文内容,具体请参考“省心炸鸡”,手动狗头(https://www.jianshu.com/p/b9034ce...
看Y叔的公众号发现一个有意思的箱线图展示,赶紧来学习一下:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5NjUyNzkxMg==&mid=2247...
对于集合的可视化,第一时间想到的都是韦恩图(venn diagram),一般集合不超过5个的时候,可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加,比如说五个的时候,你就很难从图中解...
还记得上次文章的最后提到CORNAS这种方法吗?最近刚好在Github上看到了这个项目,就花了点时间看了下文档感觉操作也比较简单,这里记录一下使用过程,大家共同学习一下。 介...
老大让复现的是一张韦恩图,来自3个数据集,分别找每个数据集的差异基因,然后取UP和DOWN的交集。原文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/...