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    连锁不平衡(LD)分析。

    在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是非常常见的内容,同时也是关联分析的基础。在很多的遗传进化GWAS的文章中都会出现LD衰减或者block单倍型块的图。那么什么是连锁不平...

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  • R 基础绘图同时保存pdf和png

    之前遇到过要同时保存pdf和png的情况,因为是用ggplot2绘图,所以就直接用ggsave两次就可以了,但是如果是用低级绘图plot的话,就要换种办法了。下面介绍两种

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    使用pheatmap包绘制热图

    加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出

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    R 绘制花瓣图flower plot

    花瓣图 对于多样本的研究,我们可以采用绘制花瓣图来更直观展现,每个样本所独有的otu数目和共有的otu数目。 花瓣图绘制的原理 因为没有一个相关的R包,参照的是博客(http...