石河子大学第一附属医院泌尿外科副主任医师
发简信
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纯纯的ggplot2画好看的柱状图，统计、分面如果你有一个表，有三列，一列数据，一列分组，一列组别 当然也可以在柱状图上添加点，这样的好处是可以看到原始数据 如果不想显示具体的P值，还可以自动标星号， 里面加一句 当然最...
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DESeq2差异基因分析和批次效应移除差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算counts per million (CPM)，即原始reads count除以总reads...
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RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
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KEGG、GO富集分析与GSEA并不是二选一最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因做得不到结果，那是因为确实富集不到任何通路，是正常的。不妨试...
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TCGA转录组差异分析后多种基因功能富集分析：从GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID转换）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
