当一组表型同时关联多个基因时,表格可以列清楚配对关系,却不容易让读者快速看出哪些节点连接较多、不同类别如何分布。弦图把两类实体排在圆周两侧,用弦...
在多组富集分析中,我们通常需要兼顾两方面的信息:一是“哪些通路在各组中显著富集”,二是“这些通路分别归属于哪些更高层级的生物学功能类别”。若将分...
拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)是指基因组DNA片段拷贝数偏离正常二倍体状态(2拷贝)的现象,在肿瘤中广泛存在...
在科研论文中,多组折线图是展示时间序列或分组趋势的标配。但传统的小圆点 marker 在数据密集时容易重叠,读者的视线在 legend 和曲线之...
分子对接的原理和应用 在《基于蛋白口袋的多肽从头合成用于多肽药物筛选》中,我们聚焦多肽药物的计算设计策略,不少读者提出了极具实践意义的问题:若已...
导读:venn+bar组合图,上半部分用venn图梳理数据集之间的交集情况,下半部分用柱状图直接展示各数据集的元素总数。逻辑与数据分离呈现,互不...
导读:画PCA图时,如果每组只有3个重复,添加置信椭圆不靠谱,尤其当三点排成一线时椭圆会极扁甚至报错。而改用凸包,把实际数据点圈起来,仅用于探索...
导读:代谢通路富集气泡图:横轴为通路影响值(拓扑重要性,越大越好),纵轴为-log10(p)(越红越好)。优先锁定右上区域,结合各通路内代谢物丰...
导读:热图清晰展示差异代谢物在两组细胞中的表达模式,桑基图将代谢物关联至各自所属的代谢物类别。热图+桑基图组合图整体布局层次分明,便于快速识别受...