一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别 -
GSEA的leading edge analysis(LEA)
前面在GSEA可以做什么[https://www.jianshu.com/p/1cc9f6c20ef6]中列了GSEA的一些应用场景，这个算其中之一，也是相对被遗落的一个分析...
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R数据合并join的分类合并过程可视化
文章来源于：https://github.com/gadenbuie/tidyexplain#relational-data[https://github.com/gaden...
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ACCDB MDB Explorer 2.4.7 for Mac 破解版 (Access查看导出工具)软件介绍/功能 ACCDB MDB Explorer 是一款 Microsoft Access 数据库查看工具。可以查看ACCDB，MDB，ACCDE，MDE数据库文件并将其...
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君子之心事，天青日白；不可使人不知；君子之才华，玉韫珠藏，不可使人易知。
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应该是将数据归一化，能比较
R语言GEO数据挖掘02-解决GEO数据中的多个探针对应一个基因
解决GEO数据中的多个探针对应一个基因 当我们来到这一步时我们默认经过前期的处理，你已经获得了表达矩阵的数据，获得了探针的注释信息。在进一步探索过程中我们发现了一个存在多个探...
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R语言GEO数据挖掘03-limma分析差异基因limma分析差异基因 在经过了前两期中的数据下载，数据基本处理之后，解决了一个探针对应多个基因数的以及多个探针对应一个基因求平均值，在此基础上运用limma包分析差异基因除...
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一文阐述链特异性测序——stranded? reverse-stranded? un-stranded?小小的眼睛里，装着……大大的疑惑 全文2800字，伤脑筋…… 今天尝试把自己对于 stranded、reverse-stranded、un-stranded 这个问题的理解给...
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太感谢了 讲的十分明白！
RNAseq分析如何选择 参考基因组 和 gtf
转自：https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCrvsz4gAkieTWYjRQ[https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCr...
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RNAseq分析如何选择 参考基因组 和 gtf
转自：https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCrvsz4gAkieTWYjRQ[https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCr...
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# wes分析时的bed文件相关问题
在WES中，因为测序只针对外显子区域。因此，我们就当只分析外显子区域，这就需要引入一个表示外显子区域的INTERVAL文件，既可加快分析速度，也可以降低OFF-TARGET，...
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全外显子测序数据分析TITLE: 全外显子测序数据分析AUTHOR: Shuntai Yu [TOC] 外显子是形成mRNA后剪接剩下的部分，包括UTR区与CDS，而CDS则是真正编码蛋白的...
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wes测序遇到的问题及如何解决|更新
注：如何想看WES正常流程建议查看”wes流程.md“ 1.分lane测序的数据是先合并再比对，还是先比对再合并？ 先说结论：在WES和WG中，应该先比对fq生成bam后，质...
