软件安装 剪切位点强度计算 支持 suppa2, rMATS输出结果。可直接计算各位点强度得分。该软件是对MaxEntScan(http://hollywood.mit.ed...
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可变剪切位点强度计算[自用] -
使用scVelo进行RNA velocity分析-01scVelo于2020年发表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3]，...
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clustree ： 聚类可视化利器我们知道在研究问题时，分组是很重要的，有分组才有故事可讲。比如，两块田一块施肥一块不施肥，可以做比较嘛。在单细胞数据分析中用到较多的数据分组技术是聚类（clustering）...
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Seurat包------标准流程单细胞学习入门教程，里面的东西可以反复琢磨，标准分析基本上就这么多内容。教程中提到了大量的资源介绍，参数含义解读，甚至高级部分的简洁版算法介绍，结果解读，可视化方法，以及数据...
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10X单细胞转录组与10X单细胞ATAC联合分析之Seurathello，大家好，这是第一次和大家分享有关10X单细胞和10XATAC的联合分析，我们这一次来深入看一下10X单细胞和10XATAC的联合分析方法（Seurat）。 Int...
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使用Trinity 软件进行拼接（无参转录组）文章背景（此背景非彼背景） 本文主要是对Trinity软件的背景、安装以及参数做一个详细的介绍。别问为什么没有接着做 02——转录组分析——软件下载；因为发现师兄留下来的...
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单细胞转录组测序分析--初探Seurat单细胞转录组测序--闲言碎语 时代发展的步伐总是毫不留情的将你甩在身后，连车尾灯都看不见。当你还在沉迷于普通转录组数据挖掘时，已经有人悄悄的搞上单细胞了。单细胞转录组测序，顾...
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单端测序与双末端测序问题
问题 Paired-End测序与Mate-Pair测序相对于单端测序有何优势？ Paired-End中的Read1和Read2到底是啥关系？它们是如何参与拼接和比对的呢？ M...
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外显子、内含子、mRNA,CDS区别关于基因理论知识补充：外显子、内含子、mRNA,CDS区别 1、DNA复制：以DNA为模板，在DNA聚合酶的催化作用下，将四种游离的dNTP按照碱基互补配对原则合成新链DNA...
